Во втором сезоне сериала «Доминион» Алекс отправляется в Нью-Дельфи, чтобы заключить союз с лидером еще одного выжившего города. Он будет очень удивлен тому, что его там ждет, и какие порядки в Нью-Дельфи. В это время в Веге разгорается гражданская война. Повстанцев возглавляет простая девушка Зои, которая планирует отнять власть и всех сделать равными. Теперь главным героям придется сражаться не только с ангелами и демонами, но и с другими людьми. Эта война затрагивает и соседние маленькие уцелевшие города, поэтому человечество снова оказывается на грани уничтожения.