В жизни наших героев наступает черная полоса. Сэм тяжело переживает потерю Микаэлы. А власти издают законодательный акт, согласно которому Автороботы обязаны покинуть Землю в кратчайшие сроки. Потерпев позорное поражение Фоллена, Мегатрон отчуждается от общества, а тем временем глава Кибертрона Шокуэйв разрабатывает жестокий план нападения на Землю. Действие фильма перенесет зрителей с Земли на Луну, за темной стороной которой хранятся такие же темные тайны.