Сюжет фильма «Пиксели» рассказывает о том, как в 1982 году проходит чемпионат мира по видеоиграм. Запись соревнований НАСА загружает в космический зонд и отправляет в космос. Через десятки лет происходит катастрофа, а на Землю прилетают пришельцы из космоса, которые хотят захватить планету. Чужаки восприняли посланный сигнал как призыв к войне, ведь они выглядят в точности, как герои видеоигр в 80-ых годах.

Убить пришельца обычным оружием невозможно, ведь они собой представляют сгусток энергии. Правительство принимает решение создать специальное оружие для уничтожения пришельцев. К этому делу они привлекают бывшего геймера Бреннера, который в 80-ых годах был лучшим игроком, но проиграл чемпионат мира по видеоиграм.